Η ΔΟΕ και η ΔΠΕ αποδέχθηκαν την απόφαση της Ιαπωνίας να μην επιτρέψει την είσοδο φιλάθλων από άλλες χώρες για λόγους ασφάλειας τόσο των πολιτών, αλλά και των αθλητών. Πρωτοφανές στα χρονικά των Ολυμπιακών και των Παραολυμπιακών Αγώνων. Ωστόσο, αυτό το δραστικό μέτρο κρίθηκε απαραίτητο ώστε να μειωθούν οι ανησυχίες και να κυλήσει ομαλά η διεξαγωγή των δύο μεγάλων αθλητικών διοργανώσεων, παρά τον σημαντικό οικονομικό αντίκτυπο που είχε και υπολογίζεται τουλάχιστον στα τρία δισεκατομμύρια ευρώ.